Synopsis : Deux mois ont passé depuis le dernier Killzone. La victoire a été déclarée contre les envahisseurs Helghast, la ville de Vektar a été libérée, mais pourtant la guerre continue. Les Helghast ont changé leur stratégie en s'attaquant à de petites îles aux alentours. Un nouvel ennemi est apparu : le Général Metrac. Il utilise des VIP de ISA et s'en sert comme outil de négociation. Templar est envoyé en mission de rescousse pour libérer les otages.
